2. Strings

class: center, middle, inverse, title-slide

# 2. Strings
### Ana BVA
### 25/3/2021

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</style>

# Strings

Cadena de caracteres: objeto de una serie de signos o caracteres.

```python
mensaje = "Hola Mundo"
print(mensaje)
```

```
## Hola Mundo
```

---

## Operadores de cadenas de caracteres

Los *operadores de cadenas de caracteres* ayudan a manipular los strings

.full-width[.content-box-red[+, -, *, / , =]]

---

### Concatenar (+)

Se pueden juntar strings utilizando el operador de suma `+`.

```python
saludo = "Buenos días"
```

```python
nombre = "Andrea"
```

```python
print(saludo + ' ' + nombre)
```

```
## Buenos días Andrea
```

---

## Multiplicar (*)

Se puede duplicar un string con el caracter de multiplicación `*`.

```python
print("#" * 10)
```

```
## ##########
```

```python
print("Hola " * 3 + "mundo")
```

```
## Hola Hola Hola mundo
```

---

## Añadir

Puedes agregar más strings al final del último caracter con `+=`.

```python
saludo2 = 'Hola'
saludo2 += ' '
saludo2 += 'Mundo' 
print(saludo2)
```

```
## Hola Mundo
```

---

Podemos hacerlo con variables de tipo string

```python
print(saludo)
```

```
## Buenos días
```

```python
print(nombre)
```

```
## Andrea
```

```python
mensaje = saludo + ' ' + nombre
mensaje += '!' 
print(mensaje)
```

```
## Buenos días Andrea!
```

---

## Métodos

Un método es una función que «pertenece a» un objeto.

Para ver la información completa de los métodos que se pueden ocupar en un string
consulta la [página oficial de python](https://docs.python.org/2/library/stdtypes.html#string-methods).

---

### Longitud del string

Puedes saber la longitud de un string

```python
mensaje
```

```
## 'Buenos días Andrea!'
```

```python
print(len(mensaje))
```

```
## 19
```

---

### Buscar

Puedes buscar dentro de un string

```python
print(mensaje)
```

```
## Buenos días Andrea!
```

```python
print(mensaje.find("Andrea"))
```

```
## 12
```

```python
print(mensaje.find("Kevin"))
```

```
## -1
```

---
## Ejercicio

.content-box-blue[
¿Dónde empieza el codón inical `AUG` en la secuencia

`dna = 'AAGGTACGTCGCGCGTTATTAGCCTAAT'`?
]

- Escribe un programa que te regrese la posición del codón inicial

- Output: un mensaje y el resultado

```
## El codon TAC empieza en la posicion:  4
```

---

### Minúsculas/Mayusculas

Puedes convertir todo a minúsculas o mayúsculas.

```python
print(mensaje)
```

```
## Buenos días Andrea!
```

```python
print(mensaje.lower())
```

```
## buenos días andrea!
```

```python
print(mensaje.upper())
```

```
## BUENOS DÍAS ANDREA!
```

---
### Remplazar

Se pueden replazar los caracteres usando `replace`

```python
print(mensaje)
```

```
## Buenos días Andrea!
```

```python
print(mensaje.replace('días','noches'))
```

```
## Buenos noches Andrea!
```

---
### Cortar

Se pueden elegir partes del string

```python
print(mensaje)
```

```
## Buenos días Andrea!
```

```python
print(mensaje[1:5])
```

```
## ueno
```

---

### Posición en python

```python
saludo3 = "Hello"
print(saludo3[0])
```

```
## H
```

```python
print(saludo3[-5])
```

```
## H
```

---
## Ejercicio de Rosalind

.content-box-blue[
Hacer el ejercico de [Rosalind: Strings and lists](http://rosalind.info/problems/ini3/)
]

---
## Ejercicio

.content-box-blue[
¿Dónde empieza el codón inical `AUG` en la secuencia

`dna = 'AAGGTACGTCGCGCGTTATTAGCCTAAT'`?
]

- Escribe un programa que te regrese la posición del codón inicial

- Output: un mensaje y el resultado

.content-box-blue[
¿Cuál es la secuencia que se transcribe?
]

- Output: donde empieza el codón inicial `AUG` y la secuencia que se transcribe 
(asumiendo codon de paro `UAA`)

---
Resultado del ejercicio

```
## El codon TAC empieza en la posicion  4  y termina en  24
```

```
## 
## Fragmento que será RNA  (codón inicio: TAC, codón de paro =TAA) es: 
## TACGTCGCGCGTTATTAGCC
```

---
### Secuencias de escape

Para incluir comillas en nuestros mensajes podemos usar `\`

```python
print('El programa imprime \"Hola Mundo\"')
```

```
## El programa imprime "Hola Mundo"
```

Para incluir una nueva linea puedes ocupar `\n`

```python
print('Buenos días \nBuenas noches')
```

```
## Buenos días 
## Buenas noches
```

---
### Variable + string

Incluir una variable dentro de un string puedes usar `f` al inicio y `{}`

```python
print(f'\nFragmento de RNA inicia por {met_ini}: \n{exon}')
```

```
## 
## Fragmento de RNA inicia por TAC: 
## TACGTCGCGCGTTATTAGCC
```

---
### Contar

Podemos contar caracteres usando `count`

```python
print(saludo3)
```

```
## Hello
```

```python
print(saludo3.count('l'))
```

```
## 2
```

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### Variable + numero

¿Qué pasa con los números?

```python
print('La longitud del exon es ' + len(exon))
```

```python
print('La longitud del exon es ' + str(len(exon)))
```

```
## La longitud del exon es 20
```

```python
print('La longitud del exon es ', len(exon))
```

```
## La longitud del exon es  20
```

```python
print(f'\nLa longitud del exon es {len(exon)}')
```

```
## 
## La longitud del exon es 20
```

---
## Ejercicio

.content-box-blue[
¿Cuantas `A`, `C`, `G` y `T` hay en la secuencia?

.tiny[
`dna = 'AGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGC'`
]

Resuelve el problema de [Rosalind: Counting DNA Nucleotides](http://rosalind.info/problems/dna/)

]

- Escribe un programa que te regrese la cantidad de nucleotidos

- Output: un mensaje y el resultado